与钱稻孙、许寿裳2位科长合作中华民国国徽设计案，执笔《致国务院国徽拟图说明书》（说明书全文详见2005年版《鲁迅全集》）；并设计了当时北京大学的校徽，系「北大」二字的美术字体；分管图书情报（图书资讯）业务：督导京师图书馆（后来的北京图书馆，现在的中国国家图书馆）等。直到被教育部时任署总长章士釗免职為止。
為此鲁迅向中华民国平政院提起行政诉讼并胜诉，依法可以復职，但他选择离开政府体系。
好友易培基接任教育总长后签署了让僉事周树人復职的命令，并以兼国立北京女子师范大学校长身份发出新的教授聘书，1926年318惨案爆发后，易培基等都被中华民国临时执政段祺瑞通缉了(註：鲁迅并没有被通缉)。
蔡元培将教育部改革為大学院期间，鲁迅被蔡元培聘為大学院「特约撰述员」，每月工资300圆。
大学院改回教育部后，这笔工资名义改為「教育部编译费」，仍按月支付。(1932年起，鲁迅不再兼任教育部「特约编译」。)
1926年，..南下厦门大学任文科教授。数月后，1927年，46岁的鲁迅离开厦门，18日抵达广州，19日晨在孙伏园、许广平的陪伴下「移入中山大学」任文学系主任兼教务主任，并与自己29岁的学生许广平同居。
当时是中山大学校长朱家驊请鲁迅到校。鲁迅日记：1月26日「晚往騮先寓夜餐」；2月1日（除夕）「夜往騮先寓夜饭」，騮公邀鲁迅共吃年夜饭。不久又聘顾頡刚来校，顾北大毕业才6年就当研究教授，鲁迅很不服气，声称只要顾来他便走人。2月18、19日，赴香港在上环基督教青年会礼堂举行两场题為「无声的中国」及「老调子已经唱完」的演讲。
1927年，鲁迅辞去中山大学职务到达上海，10年之久，一直住在上海公共租界北区的越界筑路区域（所谓「半租界」，是指今天虹口区北部鲁迅公园一带）。那裡有特殊的政治环境保护他写作免遭迫害，以及他不少的日本朋友。
1930年起先后加入中国自由运动大同盟、左翼作家联盟和中国民权保障同盟。但鲁迅与左联领导有很多思想上的冲突，因而有人认為他是自由作家。
1927年─1936年间，鲁迅创作了很多回忆性的散文与大量思想性的杂文。翻译、介绍外国的进步文学作品。
鲁迅在上海期间，和宋庆龄、陈賡有交往。鲁迅所主持的文学团体和郭沫若、郁达夫主持的