都市，在那里工作、学习和生活。而作为巴贝尔和潘多拉首领的兵部京介及蕾见不二子两人，也被伊藤成从监狱镇内释放出来。丢入学院都市内生活。当然兵部京介的超能力依旧是被封锁的，对于这种人危险人物，伊藤成暂时是不打算解开他的禁锢的。
第三个变化是关于从英柏拉罕王国内取得的蕾雅石结晶雕刻成的贤哲之像的。
经过一番折腾，伊藤成用塞拉的基因制造了十数名天生觉醒LV7等级的心电感应能力者女性躯体，用她们当作容器，让那些寄宿在贤哲之像中的历代巫女残留念波得以重生复活。
而经过这一年多的融合改造，已经基本恢复成那些巫女的原本模样。和与用自己身体基因制造的身体复活过来的玛萨拉一起，被安置在学院都市内东北角处特建的巨大神社内生活。
至于身体基因提供者的塞拉，则与她情透意合的英柏拉罕王正式结婚，在同样安置在学院都市内的王宫中与英柏拉罕王努力制造下一代……
不过也不知道是两人的基因强大，还是他们耕耘的太过努力。总之结婚刚过一年，就一次性产下了五个小孩，让人感叹能生。
说起人，就要说到另外一个人，那名被伊藤成从[暗黑幽灵]地下基地中救出的卵子提供者的那名女性。
在伊藤成的费心救治下，那名名为林里佳，本身有着高达LV7等级的催眠能力的棕发女性终于从昏迷中苏醒过来，并在得知自己事情后主动与YURI相认，目前正与YURI、娜依、派蒂库鲁生活在一起，而原本与他们生活在一起的半藏则被安排到另一处居住。
说完了人，就再说下魔方世界里的科技情况。
除去先前提到过的重要发明空间门外，大实验室内目前正在进行的还有两项科研改造，其一就是在数名超能力者的配合下，对大天使号进行超能化改造。即是让大天使号拥有空间跳跃能力，虽然一次性的跳跃距离不会很远，但只要继续研究下去，大天使号迟早会拥有超远距离空间跳跃能力。
其二是人体动力外骨骼的研发工作。不过这像工作的难度比较大，即使有着黑球科技、纳米科技、DSSD组织提供的人体仿生学科技等多重尖端科技资料打底，依旧使得研究工作陷入了瓶颈阶段，收获甚少。
而相必起大实验室内的那两项短时间内不见得能取得什么成果的大型研发工作，PLANT生物实验室里的基因药剂研究却是已经取得成果，并且还在精益求精的对基因药剂进行精化研究。