甲在唐世济等人的支持下进入了兵部，升任兵部尚书，但目前杨嗣昌没有彻底交出权柄的打算，仍然以东阁大学士身份“掌兵部事”，主持大局，尤其是面临清军压境，他干脆直接搬到兵部办公，越俎代庖，陈新甲只能以尚书身份干侍郎的事情。
不过表面上陈新甲没有任何不满，初来乍到的他上至杨嗣昌、下至郎中、员外郎、主事等各级官吏都笑脸相迎，没有一丝抱怨，这让杨嗣昌很满意，其他官吏也对新任尚书印象极好。
杨嗣昌翻阅到其中一份奏报时，皱眉道：“又是他出幺蛾子！”
陈新甲连忙放下手中的纸笔，问道：“阁老，出了什么事？”
杨嗣昌不满地说：“派出去的人回报：关宁军和大同镇王朴已经按照兵部命令调防京城广渠门一带，可是文登营那边却拒绝了命令，在保定按兵不动。”
陈新甲一听是陈雨的事情，格外上心，小心地解释：“或许不是直接抗命，而是没有及时拔营也不一定呢？文登营从威海卫赶来，路途遥远，人乏马疲，多休整几日也是可以理解的。”
“又哪里是休整了，这位文成伯牛气得很，他是当面拒绝了命令，声称不服从兵部调遣，哪里也不去！”杨嗣昌恨恨地说，“本官早就说过，此人一旦得势，就会拥兵自重，尾大不掉，果然被我言中。”
他想了想，站了起来，“不行，本官要入宫，向圣上禀明此事。一支勤王的兵马居然不服从兵部命令，真是岂有此理，往小了说是桀骜不驯，往大了说是居心叵测——鞑子就在京畿虎视眈眈，他既然来了北直隶，却抗命不遵，谁知道是不是通虏？”
陈新甲有些担心这个暗地里的盟友，打算早点了解上头的意思好给陈雨提个醒，便主动请缨：“下官的职责是协助阁老管理兵部，无论圣上有什么交代，都要下官去操办，要不要下官陪阁老一起入宫，免得阁老来回奔波传达圣意？”
杨嗣昌想了想，点点头：“兵部的事迟早要全部交给你，也罢，你就跟着本官一起入宫吧。”
陈新甲立刻抢在前面出门，吩咐：“备轿，阁老和本官要进宫。”
两顶轿子一前一后，在差人的簇拥下往宫城行进。兵部衙门在皇城承天门外，直接往北面走就能进入皇城，就在一行人到了承天门附近时，却被前方大群围观热闹的百姓挡住了去路。
杨嗣昌掀开帘子，不悦地问：“来人，去看看怎么回事，不要耽误本官面圣。”
几名听差立刻飞奔上前，大声说：“东阁大学