科举是关乎朝廷信誉、民心和天下稳定的一等大事。
为了防止考生和考官联合舞弊，省试每考完一场，收缴答卷时，考生均需在姓名下方指定区域留下双手大拇指指印，考生答卷收齐之后，由借调的禁军士兵统一糊名。
除此之外，在考试结束之后，考官也不会马上开始阅卷，因为为防止考官认得考生笔迹而舞弊，所有糊名考卷都会重新编号，而后有其他人在贡院内将编号后的考卷誊录一遍，而阅卷考官能见到的便只有誊录过后的考卷。
同时，为防止阅卷考官因为个人偏好不同，对考卷评价影响过大，每一份考卷都会有多名阅卷考官共同评阅。
整个阅卷过程分为初阅、复阅两个阶段，初阅阶段会将多名阅卷考官都评价为“劣”的考卷淘汰掉，在“劣”、“优”评价意见不合考卷和评价为“中”、“优”的考卷都会进入复阅阶段。
进入复阅阶段的考卷，为避免阅卷考官受考卷初阅评价影响，会再次誊抄一遍，誊抄过后的考卷依然会有编号，用来证明考卷所属的编号还是会糊上。
但为避免阅卷中考卷丢失，每张誊抄后的考卷在显著位置都有顺序编号，阅卷前有五百份，阅卷完毕，也必须是五百份，一份不能多，一份不能少，如果出现意外，没有查清之前，谁都不能洗脱嫌疑，没有主考官允许，谁也不能离开贡院。
所以省试之后阅卷阶段之谨慎、复杂，并不比后世高考阅卷差多少。
复阅结束后，按考试科目每场各取前两百名考卷，而后拆封初阅、复阅考卷进行一一核对，若两次评阅差距过大，则由主考官挑选考官再次评阅，直到达成一致意见，各科前三名由主考官亲自复阅，若对既定评阅有异议，则组织三名以上考官再次评议，直到意见一致。
初阅、复阅结果确定之后，拆去誊抄卷糊名，然后将同一考生不同科目的三张或两张答卷成绩相加，初步排定名次，总成绩前三名再次由主考官组织五位以上考官复阅。
待考生成绩确定，名次排定，依次拆封考生原卷，将同一考生的原卷与复阅誊抄卷一一核对，若原卷与复阅誊抄卷一字不差，则该考生省试成绩最终确定。
待所有考生原卷核对完毕之后，封存在兰阳县精武军驻地的各州府考生资料统一送到礼部贡院，两相核对。
省试考生原卷与从州府收集的州试答卷上均有两枚指印，仔细比对过指印之后，再比对省试、州试答卷笔迹，两者无出入，则考生身份无误。