陈棐住进了用石料建成的克里姆林宫。同时，他还将别尔斯基放了出来，接着又让图拉城的指挥官斯捷奇金去招抚谢尔普霍夫要塞的罗斯军队。
果然，在知道自己抵抗无用知后，谢尔普霍夫要塞的长官托卡列夫率军投降了。谢尔普霍夫要塞位于莫斯科以南99公里，奥卡左岸港口，地处俄罗斯平原中部，这里属于温带大陆性气候。1339年，开始见于史籍，当时作为莫斯科南部的军事要塞，起到了包围莫斯科的作用。
与此同时，明军围困了罗斯托夫城。罗斯托夫最早记载于862年。1207年起是罗斯托夫公国的中心，但毁于蒙古入侵。1474年并入莫斯科大公国后，从15世纪起成为大的宗教中心，商业迅速发展。雅罗斯拉夫尔离尼禄湖的岸边有53公里，这里环境不错。明军让这里的罗斯军队交出瓦西里三世，并保证不伤害他的生命。
经过一天的考虑，瓦西里三世率领全家一起投降的明军。接着，明军开始抵达莫斯科大公国的北部和西部边界。明军接管了诺夫哥罗德，沃罗茨科耶、卡卢加、乌戈利茨、梁赞等城邦，并占领了普斯科夫、斯摩棱斯克等城市。
同时，明军开始大量招抚莫斯科公国的残军。对于被瓦西里三世打压的大贵族，陈棐给予了拉拢和重用。当然，他对这些贵族也有所防范。按照别尔斯基的提议，陈棐让这些人在军队和地方上任职，但是只充当大明帝国官员的副手。
莫斯科大公国被明帝国兼并，让大明帝国的土地一下子扩张了二百八十万平方公里，人口增加了700多万。这时的大明帝国和立陶宛大公国、波兰、瑞典直接接壤了。这时，大明帝国整个增加了约一千三百万人口。莫斯科大公国的原有地盘被划分为十个省。克里米亚和、喀山、和阿斯特拉罕也分别建省，加上早就被分成四个省的西部利亚，与筹划中的诺盖汗国的地盘，大明帝国一下子增加了十八个省。
陈棐调整了政策，采取了宗教宽容政策。他对于那些绿教成员开始安抚，因为他知道想征服中亚、土耳其和波斯，想减少他们的抵抗，不和绿教妥协不行。对于那些东正教徒，陈棐也给予了安抚，他许诺一定会解救在立陶宛大公国统治下的基辅。
大明帝国向莫斯科大公国的土地派遣了三十万移民本土移民，其中有十万住进了莫斯科城。左义贵总督建议向莫斯科大公国诸地移民三百万人。陈棐表示赞同，但是当务之急是在各地建立牢固的统治。大明帝国将部队扩充到六十万大军，当然这里面包含了二十万武装开拓