惊弓之鸟大内义兴进了城内，一番劝说，让藤播磨守、小佐井大和守、津久见美作守、田口藏人佐所等人觉得和明军作对，无异于以卵击石。于是，他们决定投降。
见何无敌对大内义兴十分优待，岛津胜久不理解，明军内部也议论纷纷。何无敌说：“大内义兴曾经成功上洛，在京都掌权长达十一年。虽然，他的属地经常与盘据出云的强藩尼子作战，在九州又与大友、少贰氏作战。加上他在本州岛有五国之领地，号称京都中国地方第一强藩。这样的人作为前导，我征讨日本八十八国，不是水到渠成的事情吗？”
明军的强兵很快征服了肥后国，因为岛津军和明军部队的强大，肥前国、筑前、丰前、丰后、筑后等地的小诸侯纷纷拜服。最强大的大友氏都被消灭了，号称日本关西第一强藩的大内义兴也被俘虏了。那九州岛各地的小诸侯们也没有抵抗的必要了，所以他们纷纷向大明军队献出了人质，接受改编。
唯一抵抗明军的是筑后的蒲池氏，蒲池隆信曾经收留过少贰氏家臣龙造寺家兼。少贰氏的家臣龙造寺家兼，在疏忽之下，被自己的亲家连同少贰氏主家杀了个片甲不留。不得已，他归附了蒲池隆信。蒲池隆信对龙造寺家兼以长辈视之，没想到这次明军攻城拔寨，蒲池氏如此不识时务。
明军只派岛津军将蒲池氏的居城柳川城围困，柳川城是蒲池氏数代苦心经营的一座坚固城堡，有五年时间都无法攻破之说。但是，蒲池氏忘记了，堡垒从来就是从内部攻克的。
龙造寺家兼和他的家属联合一些想投降明军与岛津军的力量忽然在半夜发难。蒲池氏一族在半夜被杀了个干净，柳川城的居民对龙造寺家兼恨得咬牙切齿，却又无能为力。
岛津军进了城，将柳川城封给龙造寺家兼。在明军的允许下龙造寺家兼又拿回了自己的居城佐贺城。
与此同时，明军和岛津军在九州岛人口和军队都进行了整编。三个老牌大名，大内义兴，岛津胜久以及曾经被大友氏攻灭的少贰氏，分别被封为关西镇守使，九州镇守使和京都镇守使。
同时，明军换上了大内义兴军队的衣服，他们准备在本州岛登陆。然后，再次上洛，接着控制幕府将军足利义晴与后柏原天皇。这样，无论哪个大名再反对何无敌的征服军。何无敌就可以以幕府将军和天皇的名义出兵讨伐他。这就是真正的挟天子以令诸侯，至少在日本大区如此。
得到梦寐以求的九州镇守使，岛津胜久兴奋的话都说不出来。这时，因为征战日久，日本各地的