崇祯三年二月，总理马世龙把朱由检赐给他的尚方宝剑交给曹文诏，命令他率领参将王承胤、张叔嘉、都司左良玉等埋伏在玉田的枯树和洪桥，因鏖战有功升为参将。
然后他从大堑山转战到遵化附近，又跟从马世龙等攻下大安城以及鲇鱼等关口。因为收复四城的功绩，朝廷给他加官为都督佥事。
七月，陕西民变势大，曹文诏被封为延绥东路副总兵，带领关宁军入关进行征讨。
崇祯四年四月，曹文诏击灭据守河曲的变民首领王嘉胤，以功升任临洮总兵官。
点灯子从陕西进入山西。曹文诏追击他们，追赶到稷山的时候，招安了七百名农民。
点灯子逃跑了，不久又被生擒后斩杀。
李老柴、独行狼占据了陕西中部，巡抚练国事、延绥总兵王承恩包围了他们。
五月，庆阳的农民军郝临庵、刘道江前去援助。恰巧曹文诏从西面凯旋，就同榆林参政张福臻联合围剿他们，杀死了李老柴及他的同党一条龙，其他的同党逃往摩云谷，副将张弘业、游击将领李明辅战死。
曹文诏于是就同游击将领左光先、崔宗荫、李国奇分别围剿绥德、宜君、清涧、米脂等地的贼寇，分别在怀宁川、黑峪泉、封家沟、绵湖峪等地展开战斗，都取得了重大胜利。扫地王被斩首。
红军友、李都司、杜三、杨老柴都是神一魁的余部，他们屯兵镇原，准备攻打平凉。
练国事发布檄文要求甘肃总兵杨嘉谟、副将王性善扼住他们的攻势，农民军只好败退到庆阳。曹文诏从陇州的小路出发前来同杨嘉谟、王性善会合。
崇祯五年三月，曹文诏与农民军大战于西濠，斩首千级，生擒杜三、杨老柴。他们的余部纠合另外的农民军洗掠了武安监，占领华亭，又在攻打庄浪。
曹文诏、张嘉谟赶到，农民军屯兵张麻村，明军直压过去，合力打击他们，农民军逃往高山上了。
游击将领曹变蛟、冯举、刘成功、平安等人呐喊着冲了上去，农民军又一次败逃。
这时王性善与甘肃副将李鸿嗣、参将莫与京等到来，他们一起战斗，斩获了五百二十多个首级。
明军乘胜追击，先后在咸宁关、关上镇打败了农民军，追到陇安时，嘉谟和变蛟联合夹攻，又打败了他们。
几千名残余农民军想逃往汉南，被游击将领赵光远阻截，于是从长宁驿逃到了张家川。
有一支从清水分出的贼寇力量较强，副将蒋一阳