一路上在小刚羡慕嫉妒的注视下，沐雨同小智一起来到了港口。随后同剧情一样，小智一行人收到火箭队派发的免费船票，最终登上了圣安奴号。、来到大厅发现里面正在举行巨大派对，各式各样的认士，聚在一起。沐雨觉得太吵就先回房休息了。
随着剧情开始，小智在与绅士对战，就在小智即将获得胜利时，绅士收起精灵，随后离开了。不久后绅士又找到小智要求交换精灵，最终以小智拒绝而告终。
终于，火箭队按奈不住，跳出来开始抢夺训练家的精灵。
此时正在休息沐雨，房门突然被踹开。“这艘船已经被我们火箭队控制了，如果不想受到伤害就把精灵交出来。”火箭队小喽喽嚣张的叫道。
“是吗？“沐雨瞬间来到火箭队队员身边，指抢瞬间发出，”砰“火箭队队员倒飞出去。
”已经开始了吗？“沐雨不由加快脚步搜寻小智。
此时，大厅内训练家们正在和火箭队剧烈的战斗着，这时一个巨浪打了过来，整只船正摇晃不定，随时都有可能沉没。
“小智你在干什么！船有可能快沉了，还不快走。”小霞焦急催促着小智。
“沐雨还在房间，我要去找他。”说着小智向沐雨房间跑去。
“对啊，沐雨还在房间里，我们也快追上去。”小霞对着小刚说道。
片刻后，沐雨与小智等人在楼道里相遇。
“你们还来找我干嘛？船都要快沉了。”沐雨对着小智等人说道。
“我们不是朋友吗，怎么可以丢下你一个人不管。”小智大声回道。
“好了，快走吧！等脱离危险后我们再谈。”小刚催促着说道。
这时，巨大海浪再度席卷而来，瞬间将圣安奴号掀翻，沐雨等人反应不及瞬间晕了过去。
圣安奴号沉默之处，营救队君莎小姐正在哀悼在此处遇难的小智一行人。
此时，沉没在海底的圣安奴号内部，沐雨缓缓清醒过来，晃了晃晕乎的脑袋，使自己清醒点。随后叫醒还在晕倒的小智等人。
小智等人来到窗前看着海里的神奇宝贝后惊呼道“难道我们现在是在海里。“
“走吧！现在我们抓紧时间找出口逃出去。”
随后，随着小霞派出角金鱼，带回了火箭队，最后大家通过小精灵的帮助，终于到达动力室，最终大家决定烧毁天花板后用水系小精灵逃出。
“大家都准备好水系精灵，准备逃出去。”小刚