倾向于英国军舰，所以只打造了三艘作为侦察船后，就停止了打造。
这三艘船现在轮流往返于澎湖和打鼓港之间，相比金门的情况，周琅更关心澎湖战况，只要清军跟朱濆依然在澎湖死战，那么偷袭金门的计划，就不会受到干扰。
周琅发现李长庚作风顽强，但进攻却十分保守，并没有直接攻击朱濆的老巢，没有攻击澎湖本岛的妈公港，而是先从外围打起，一座岛屿一座岛屿进攻，一座炮台一座炮台进攻，几乎攻占了澎湖外围所有的要地。
周琅不由有些担忧起朱濆来了，显然他的对手是一个经验很丰富的强敌，澎湖本岛位于列岛中央，外围据点的丢失，意味着朱濆几乎陷入被包围的窘境了。
周琅即担心朱濆的安危，也担心金门之战的结果。如果朱濆顶不住李长庚的压力，自己的舰队进攻金门又受到挫折的话，这次偷袭计划基本上就破产了。朱濆此人如果战死，周琅也觉得很可惜，毕竟对方是目前中国沿海最大的反清力量之一，就此灭亡实在是可惜。
而且朱濆的作风跟普通海盗有所区别，他虽然也做海盗的买卖，但更多的是冲着海贸去的，他更像是郑芝龙，而不是张保仔，一旦给予纠正，他很容易就能转化为海商集团，是难得的海洋贸易力量，死了着实可惜。
一个月后，李长庚已经开始进攻澎湖本岛，朱濆岌岌可危。
这时候金门的消息终于传回来了，顺利攻占金门和厦门两座岛屿。
收到消息后第一时间，周琅马上传令留二十艘老闸船防卫金、夏，一直到舰上随行的技术人员完善两岛的炮台防御。十六艘主力舰立刻返航，赶赴澎湖，但并不是去解救澎湖，而是去解救朱濆。
周琅的作战目的是，利用自己船坚炮利的优势，压制李长庚控制的炮台，然后冲破李长庚舰队的封锁，进入澎湖港内，但并不是帮助朱濆坚守，而是接应朱濆撤退。在外有李长庚围困之危，内有周琅舰队接应的情况下，朱濆这个海盗不可能有什么死守汛地的念头的。
下完这些命令之后，周琅才有心思思考一下眼前的局面。
根据金夏之战的状况回报，两岛清军的防守极为松懈，炮台根本就没有起到作用，大半大炮年久失修，竟然有超过六十年的老炮。这种海防，根本就挡不住正规舰队的攻击。
这个消息让周琅很欣喜，打下金门是基本要求，打下厦门则是最优选择，这样就可以用这两座岛屿控制漳、泉地区的出海通道，可以利用九龙江和晋江两条通往福建内陆