第二日辰时，刘宗敏的大军准时向城下移动，到了城下，二话不说，直接包围了叶尔羌城，不过，主攻的方向是西城。
两个师所有的山地炮，全部集中在西城外，另外三座城门外，各有一个团，其余的五个团，也是集中于西城外。
刘宗敏并没有试探性攻城，先是用火炮猛攻，直到城头上看不到守军，然后炮火向城内延伸，连着轰炸了大半个时辰，方才使用步兵攻城。
果然不出意料，城内的守军，不是伤亡于开花弹，便是被开花弹吓傻了，在步兵攀登城墙的过程中，竟然没有遭到抵抗。
战斗比刘宗敏想象的还要顺利。
叶尔羌城是刘宗敏进入叶尔羌境内拿下的第一座城池，有了叶尔羌城，大军算是在叶尔羌境内立下根基，必须好好经营，尽快实现真正意义上的占领、汉化，做为大军的屯粮基地和依托。
刘宗敏入城之后，立即传出军令：城中的守军，包括汗王阿布都拉哈和文武官员，一律诛杀!
至傍晚时分，阿布都拉哈的汗王宫被攻破，百官和守军基本上被诛杀殆尽，幸存的士兵，早已脱下铠甲，汇入百姓之中，刘宗敏这才放下屠刀。
刘宗敏知道，叶尔羌成是黑山派的老巢，在城内的影响力巨大，第二日一早，便传出新的军令：黑山派的人，因为协助阿布都拉哈守城，一律诛杀!
凡是身着黑袍戴着黑帽的人，都是天命军诛杀的对象，除了年轻的女子可以幸存，男女老幼格杀勿论，家产抄没。
城中顿时成了屠宰场，无论是王室的成员，还是城内的高官，基本上都是黑山派的人，军士们屠杀、抄家的时候，除了年轻的女人，还缴获了不少粮食和银子，这是离开南原省宛丘府之后，斩获最多的一次。
一日之间，城中富贵之家被屠杀一空。
第三日，刘宗敏又传出军令，城中的白山派，并没有打开城门，接应天命军入城，也是罪不可赦，论罪当诛，不过，只要他们愿意“入汉籍”、“用汉名”、“奉天主”，天命军就会饶恕他们的一切罪行，犹豫不决的人，一律诛杀、抄家!
叶尔羌城内并没有多少白山派的信徒，但今日主要不是为了屠杀，而是在前两日屠杀的基础上，以威慑、劝慰为主，也是耽搁了一日的时间，不过，绝大部分白山派的信徒，都是归化为汉人。
再一日，赵烈、高禄各率一军暗暗离开叶尔羌城，直扑西北方向的英吉莎、喀什噶尔，刘宗敏则是留在城内，继续归化残余的百姓