岛众的势力又逐渐恢复了起来，他们率军突袭九鬼家族本城田城；九鬼嘉隆与兄九鬼净隆协力奋战，暂时抵挡住了敌人的进攻，但不幸的是九鬼净隆在一次战斗中战死，九鬼家族从此组织不起抵抗，其家族本城田城陷落，九鬼嘉隆逃往朝熊岳。
九鬼嘉隆经过三年的雌伏整顿，其家族又恢复了往日的军力，并拥戴其兄九鬼净隆遗孤九鬼澄隆举兵反攻；九鬼家族经过奋战，又重新夺回了自己的家族本城田城。
九鬼澄隆成为志摩九鬼家族第七代家督后不久，突然病死，于是由嘉隆继任，为志摩九鬼家族第八代家督；九鬼嘉隆继任家督后，新筑鸟羽城为九鬼家族本城，成为了志摩国最大的势力。
世人都知道，九鬼家族第七代家督九鬼澄隆的突然死去，十之八九是九鬼嘉隆的阴谋；为了夺取势力而不惜手段杀害自己的侄子，而后谎称病死，这种残酷的行为在大和帝国并不罕见。
掌握了志摩国，击败了七岛众，九鬼嘉隆的下一个敌人就是伊势国司北田家族；九鬼嘉隆作为家族本城而构筑的鸟羽城，正好处在伊势神宫势力范围内，可以说是侵犯了神领。
于是，北田家族大举起兵，联合对九鬼嘉隆不满的志摩其他家族，攻入九鬼家族领地内；九鬼嘉隆率领九鬼家族军队拼死抵抗，打退了伊势国司与志摩家族的联军，北田军逃回伊势安浓津城。
没过多久，九鬼嘉隆迎来了他命运的转折点；在织田家族重臣泷川一益的仲介下，九鬼嘉隆与织田信长取得了联系，随后九鬼嘉隆便正式出仕织田家族，成为织田家族的水军大将。
出仕织田家族的第二年，九鬼嘉隆的九鬼水军作为织田家族征伐伊势的先导，在攻灭北田家族的战斗中立下大功，被织田信长授予志摩一国作为奖赏；得到志摩国及其附近外海控制权的九鬼嘉隆，将“熊野十三水军”收编，组成织田家族的水军，为织田家族效力。
协助织田信长平定了伊势以后，九鬼嘉隆又率其麾下水军参与织田家族征讨伊势长岛一向一揆的战斗；率十四艘安宅船活跃于长岛之战中的九鬼嘉隆，为织田家族歼灭长岛一向一揆的战斗做出了巨大的贡献。
但是，织田家消灭长岛地区的一向一揆武装，并没有使石山本愿寺门徒众的士气低落；长岛合战的结果，反而刺激了他们反抗的决心，让他们又一次组织起了更大规模的一向一揆武装。
当时，石山本愿寺与称雄山阴、山阳两道的毛利家族是同盟；本愿寺笼城的人数庞大的门徒众的后勤补之所以能够