了莫罗，希望他支持自己。由于对督政府的不满，莫罗同意与波拿巴合作。雾月18日政变后，莫罗率兵将两名督政官软禁在卢森堡。作为回报，他又得以指挥莱茵军团在中欧作战。
这一次进军十分顺利，奥地利人又被打回了伊萨尔河东岸。回国后，经约瑟芬介绍，他与一名叫米莉·奥洛的克里奥尔女子结婚。
莫罗万万没想到，这位新夫人其实野心勃勃，对权力有很大的渴求，日后给他惹下大麻烦。新婚后不久，莫罗就重返战场。
1800年12月3日，莫罗迎来了自己戎马生涯的巅峰之战——霍恩林登战役，是役莫罗以损失2500人的代价歼敌1.4万人，为粉碎第二次反法同盟奠定了基础。
而此时他的夫人奥洛正在巴黎秘密网罗对拿破仑不满的人，企图推翻拿破仑。一些保皇党人偷偷跑来找莫罗，希望由他来领导推翻拿破仑。莫罗虽然对拿破仑的独裁统治不满，但是仍持有坚定的共和立场，拒绝参加复辟路易十八。但这些小动作没能逃过富歇的眼睛。这位一举擒获了阴谋的参与者。拿破仑深知莫罗在军中威望很高，于是他强迫莫罗发表声明与阴谋复辟之事无关，随后表现出宽容姿态，将莫罗从轻判罚，判其流放。
莫罗先是被软禁在西班牙，后去了美洲，居住在东海岸附近的莫里斯维尔（到现在，帝国还有以他名字命名的莫罗镇）。
经过这番变故，莫罗已是心力交瘁。来到大洋彼岸的美洲，他本来想平静心态静心修养。也就在这期间莫罗和君主派真正开始联系并在这个阶段协助西班牙镇压了南美洲玻利瓦尔独立运动，让整个美洲都落入了帝国手中。
这种安静的日子没持续多久。
拿破仑侵俄失败，第六次反法同盟建立的消息。瑞典王储，原是拿破仑麾下元帅贝尔纳多特向沙皇亚历山大一世推荐了莫罗。
随后，贝纳多特又亲自与莫罗会谈。经贝纳多特一番劝说，莫罗同意再次出山，反戈一击。莫罗向反法君主建议，不要攻打拿破仑亲自指挥的部队，而要攻击他分兵在外的将领。因拿破仑喜欢抓权，常常越级指挥，他的将领大都没有独立作战能力。这一招果然奏效，拿破仑在战场上疲于奔命，甚至一天累死了五匹马，法军连吃了几个败仗。但是莫罗没能看到拿破仑的退位。1813年8月23日，莫罗在德累斯顿战役中被一发炮弹被打断了双腿。在艰难支撑了几天后。
1813年9月2日，一代名将咽下了最后一口气。
莫罗死后，欧洲