经过这一战后，两军进入了僵持阶段。虽然平日里，足利义昭麾下与众寺僧兵也会攻城，但绝对没有像第一次那样疯狂。就连延历寺众僧兵在接下来的进攻中也不再向之前那样疯狂，显然他们已经得到了觉恕法亲王的暗示。
而氏宗更是乐得如此，城中的粮食足够大军吃上一个多月的时间，而守城用的武器更是不用有任何担心，敌人一来，就玩命的往外招呼，反正众人都知道，不用也是浪费，用不了多久本家的援军就会到来 。
粮食，武器充足。不久后又有援军到来，所以城中守军虽然被困城中，但士气却十分高涨，相比之下，城外的敌军到是显的暮气沉沉。,
开始几战，氏宗还会在城墙上进行督战。不过在将敌人打退几次之后，氏宗也就不这么积极了，敌人自己都在互相拆台，老子还但什么心啊。
一连攻击几日，进攻的次数也随之越来越少，这可把足利义昭给急坏了，别看现在逆贼高山氏宗只占有这一座城池，看起来不影响大局，不过事实上，谁都知道，如果不将这颗钉子拔除的话，那么根本无法进攻他处。
高山氏宗麾下还有一千余军势，如果自己率军去进攻山城国中其他织田家城池，那么高山氏宗便可趁这时进攻本家领地或者各座寺院，以织田军的战力，想要攻下那些地方根本就是轻而易举的事，如此一来，这便等于是双方交换场地，根本没有任何意义，而且高山氏宗的根本不在山城，他可以不在乎，可自己和各寺院住持却不能不在乎，一旦让其夺了寺院，那么对联军士气的打击无疑是巨大的。
足利义昭也不是没有想过留下一部分军势在这里牵制城内军势，而剩下的军势去进攻，不过留多少军势合适呢，这几天下来，联军的消耗不可谓不大，原本来时的五千五百人，现在只剩下四千八百，要是留多了，想要进攻他处将会变的很困难，可留少了，说不定就会被织田军吞掉，在军势本就不多的情况下，谁也不敢冒险。
而在这几天中，足利义昭经常将众寺住持找来商议，不过在一次次的争吵之后，却根本讨论不出什么结果。
就在足利义昭与众寺住持在城外一筹莫展之时，南近江的局势却发生了很大的变化 。
织田家众人充分执行了明智光秀的命令，明智左马介，斋藤利三等武士在大军撤退的当晚便悄悄率领军势离开，埋伏在不远处，而明智光秀则是率领大军趁着夜色悄悄离开，一路向西直奔长光寺城而去。
虽然僧兵众在得知敌人退去后便马上进行追赶，